More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5570 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 198 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  56.92 
 
 		 213 aa  214  5.9999999999999996e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  54.69 
 
 		 211 aa  204  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1950  TetR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663338  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  42.35 
 
 		 222 aa  134  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2079  transcriptional regulator, TetR family  40.31 
 
 		 208 aa  114  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.674297  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1914  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0039  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4596  regulatory protein TetR  35.37 
 
 		 196 aa  102  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1470  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 213 aa  94.7  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2290  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0794358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4996  transcriptional regulator  38.92 
 
 		 197 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4968  transcriptional regulator, TetR family domain protein  39.19 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22560  transcriptional regulator, tetR family  32.8 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0880115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  40.91 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  31.33 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4012  transcriptional regulator BetI  32.32 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  36.36 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3750  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  27.92 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.833551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3580  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  27.92 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.344721  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  28.28 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3653  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  28.28 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.451581 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  31.88 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17920  transcriptional regulator, tetR family  28.12 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.330701  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  34.07 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 677 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  34.07 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  22.67 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3687  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  27.41 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0386851 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1332  transcriptional regulator BetI  33.78 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  35.16 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  35.16 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  35.16 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  32.98 
 
 		 278 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  36.05 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3559  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  26.26 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00735263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3647  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  26.77 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0126984  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03122  DNA-binding transcriptional regulator  26.77 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0442  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.671353  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3457  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  26.77 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315342  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  32.97 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03073  hypothetical protein  26.77 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.807649  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  34.94 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3749  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  26.77 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000431628  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 298 aa  54.3  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  34.94 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0442  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  26.77 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  26.77 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00305215  normal  0.159786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  32.97 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  32.97 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  32.95 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  26.97 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  35.63 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  32.97 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 233 aa  53.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  32.97 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6159  transcriptional regulator BetI  35.71 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70970  transcriptional regulator BetI  35.71 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.790986 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.46 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>