More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2630 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 206 aa  228  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  55 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6709  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.408759  normal  0.497229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  40.66 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1598  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535122  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6233  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275362  normal  0.0744328 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  33.12 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3543  Transcriptional regulator TetR  34.53 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  50.82 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  50.82 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1537  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5348  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1426  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  36.75 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0796  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1492  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6653  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713495  normal  0.0271875 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2113  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.473372  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3875  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.417982  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.25 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.25 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 228 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2692  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 225 aa  62  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2128  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 251 aa  62  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5724  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 230 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5968  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 230 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.609129 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0479  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 239 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  62  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4062  TetR family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0381  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1810  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.24 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3453  transcriptional regulator TetR family  26.95 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3905  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  60.42 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  29.76 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3581  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  33.66 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853887 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  31.63 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2247  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  26.76 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1960  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>