More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0611 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  74.87 
 
 		 198 aa  261  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 192 aa  176  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3794  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3867  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  33.53 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4249  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.399807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  38.04 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  40.3 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  37.29 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.62 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.62 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.62 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.62 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.62 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.36 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  40.62 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.62 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.62 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.62 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  40.62 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.62 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.62 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.62 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4830  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 226 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 244 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 278 aa  53.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 232 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 219 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1170  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  40.32 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 181 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3664  regulatory protein, TetR  32.12 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  32.97 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 87 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 228 aa  52.4  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 310 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  31.18 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 208 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03122  DNA-binding transcriptional regulator  40.32 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0442  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.671353  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  40.32 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00305215  normal  0.159786 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0442  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  40.32 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2734  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 225 aa  51.6  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3647  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  40.32 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0126984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>