More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5186 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 185 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 222 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  48.59 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  45.05 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 191 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  36.08 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 213 aa  77.8  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  45.26 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  40.86 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  35.56 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  38.37 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.37 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  38.37 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.37 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.37 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.37 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.37 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.37 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 286 aa  58.5  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 236 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  35.44 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.02 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.02 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.02 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.02 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.02 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2734  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0103  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.462043 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.02 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>