More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3664 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3664  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 182 aa  358  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  80.77 
 
 		 182 aa  295  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 191 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3794  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3867  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 291 aa  58.2  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 199 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1170  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 223 aa  52.4  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 453 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 195 aa  52.4  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 202 aa  52.4  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 222 aa  52  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 770 aa  52  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  30.36 
 
 		 346 aa  52  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 203 aa  52  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  45.78 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 197 aa  51.6  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 191 aa  51.6  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3937  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  51.6  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  31.13 
 
 		 211 aa  50.8  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  28.69 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  40 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 217 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 332 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 221 aa  49.7  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  31.91 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  41.94 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  34.91 
 
 		 400 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  31.18 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4249  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.399807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 203 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 228 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 231 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 255 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 229 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1640  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 226 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>