More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3937 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3937  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  60.78 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4783  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.690259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  43.9 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  45.95 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  38.55 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  54.9 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  44.59 
 
 		 193 aa  52  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 219 aa  52  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 216 aa  51.6  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3664  regulatory protein, TetR  40.91 
 
 		 182 aa  51.6  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  49.02 
 
 		 221 aa  51.6  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 219 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 194 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 242 aa  51.2  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 209 aa  51.2  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 200 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  43.14 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  39.29 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 258 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  34.41 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5169  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 225 aa  49.3  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 217 aa  49.3  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 226 aa  48.9  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 223 aa  48.5  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 196 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 199 aa  48.1  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 243 aa  48.1  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 222 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 197 aa  48.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 238 aa  48.1  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 210 aa  48.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  48.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 208 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 201 aa  47.8  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 192 aa  47.8  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 195 aa  47.8  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 125 aa  47.8  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  51.06 
 
 		 208 aa  47.8  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  40.74 
 
 		 241 aa  47.8  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 218 aa  47.8  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 204 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  34.96 
 
 		 202 aa  47.8  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 204 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 204 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  39.22 
 
 		 346 aa  47.4  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 239 aa  47.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  45.1 
 
 		 236 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  51.06 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>