More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0986 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 215 aa  234  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 201 aa  232  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0180  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 193 aa  95.5  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0296493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0183  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 193 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0212  transcription regulator TetR/AcrR family protein  34.38 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0194  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  43.3 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3071  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0385264  normal  0.592961 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  24.5 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 125 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  41.41 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_0500  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_2223  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360909  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000716  transcriptional regulator  29.07 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.421465  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 421 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 403 aa  58.2  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  25.34 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4951  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717286  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  47.14 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009523  RoseRS_2103  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  26.09 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  25.47 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 324 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5533  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374337  normal  0.0421471 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
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NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 243 aa  52.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1677  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 257 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.981661 
 
 
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NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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