More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5785 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  440  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  60.98 
 
 		 234 aa  264  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  56.88 
 
 		 258 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 217 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 217 aa  245  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 219 aa  237  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 204 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  33.82 
 
 		 235 aa  108  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3581  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 246 aa  95.5  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2483  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0489732  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 224 aa  62  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  46.58 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  41.98 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  25.29 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  45.45 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  43.28 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  41.33 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  37.93 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1062  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0959794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  36.46 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  28.16 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 245 aa  52.4  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 187 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6888  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 254 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 187 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 190 aa  51.6  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 187 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  34.06 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 194 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3937  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 185 aa  51.6  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 190 aa  51.6  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  38.71 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 275 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>