More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2161 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  417  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  61.88 
 
 		 204 aa  245  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  48.76 
 
 		 202 aa  208  5e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  38.07 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  31.92 
 
 		 223 aa  125  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1633  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124131  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04360  transcriptional regulator  29.32 
 
 		 194 aa  89.4  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  46.58 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  21.86 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  37.93 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5271  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.869889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2128  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.544484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  49.06 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3117  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4369  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  39.71 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  47.17 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0654  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 497 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8733  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153176  normal  0.242309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3834  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  30.1 
 
 		 278 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>