More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0599 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  400  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  47.88 
 
 		 205 aa  172  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  46.11 
 
 		 204 aa  164  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 196 aa  157  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  46.34 
 
 		 212 aa  151  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  46.34 
 
 		 212 aa  151  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0736  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0112088  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  29.53 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13181  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000106336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 273 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0016  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 232 aa  61.2  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0258  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.569121  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  47.76 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000716  transcriptional regulator  34.82 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.421465  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  28.42 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  34.78 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  34.78 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  34.78 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  34.78 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  34.78 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  34.78 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  35.71 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  35.04 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  26.56 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  34.62 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>