More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000716 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000716  transcriptional regulator  100 
 
 		 175 aa  362  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.421465  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  60.78 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 324 aa  57.8  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 212 aa  57  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 212 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 212 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 280 aa  55.1  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2538  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 205 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  53.19 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  53.33 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  53.33 
 
 		 222 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0016  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 216 aa  52.4  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 242 aa  52.4  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 202 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 190 aa  52.4  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 		 196 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 229 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 194 aa  52  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 217 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0736  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0112088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 246 aa  51.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
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NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 192 aa  51.6  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
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NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 212 aa  51.6  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 189 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  37.31 
 
 		 206 aa  51.2  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 202 aa  51.2  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  39.71 
 
 		 205 aa  50.8  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 217 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
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NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 194 aa  50.8  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_1253  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989157 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 221 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 217 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 217 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 223 aa  50.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 221 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 72 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 186 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4907  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 212 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1663  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.319165 
 
 
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NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 255 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 198 aa  48.9  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 194 aa  48.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 189 aa  48.5  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
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NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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