More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6309 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  384  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2128  TetR family transcriptional regulator  80.95 
 
 		 201 aa  274  7e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.544484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  79.66 
 
 		 189 aa  271  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2332  regulatory protein, TetR  47.77 
 
 		 189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376775  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 245 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  30.95 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  36.97 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  33.01 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0767  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.504408  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 261 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 247 aa  54.3  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 223 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  36.5 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  31.55 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 247 aa  54.3  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  33.6 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  44.57 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 230 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  43.62 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 231 aa  52.4  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000716  transcriptional regulator  49.06 
 
 		 175 aa  52.8  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.421465  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 217 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  41.51 
 
 		 237 aa  51.6  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 217 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 217 aa  51.2  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 234 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 234 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 228 aa  51.6  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 217 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 217 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 216 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 310 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>