More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2856 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  394  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  64.32 
 
 		 190 aa  245  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  64.52 
 
 		 202 aa  244  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  65.05 
 
 		 202 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  63.78 
 
 		 202 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  64.86 
 
 		 189 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  63.78 
 
 		 201 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  63.98 
 
 		 200 aa  241  7e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  63.78 
 
 		 201 aa  240  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  63.24 
 
 		 201 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  60.54 
 
 		 191 aa  234  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  61.62 
 
 		 194 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  59.78 
 
 		 190 aa  232  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  58.15 
 
 		 193 aa  228  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  56.22 
 
 		 206 aa  224  8e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  53.3 
 
 		 205 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 195 aa  166  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 192 aa  112  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 197 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 189 aa  89.4  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 203 aa  85.9  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 190 aa  85.1  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0243  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4864  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.935636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5456  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5406  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313854  normal  0.0102978 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  63.83 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  32.17 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4747  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  52.31 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5292  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.505597 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  53.85 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 220 aa  62  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 190 aa  62  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  46.48 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2228  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112072 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  46.48 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  59.57 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  32.41 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  36.96 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>