237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2228 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2228  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  388  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112072 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 202 aa  67  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  28.71 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  27.91 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  28.3 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 246 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0016  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002553  quorum-sensing regulator of virulence HapR  22.29 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03459  hypothetical protein  20.37 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  22.63 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  26.81 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 190 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 244 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0667  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 200 aa  47.8  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  37.65 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 497 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  39.29 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 280 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 205 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 237 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000716  transcriptional regulator  37.84 
 
 		 175 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.421465  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 195 aa  45.4  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 227 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 233 aa  45.8  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 222 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>