285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0077 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 183 aa  382  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 190 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4864  TetR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 192 aa  97.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.935636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5456  TetR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 192 aa  97.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5406  TetR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 192 aa  97.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313854  normal  0.0102978 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5292  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 192 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.505597 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 187 aa  95.9  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0243  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 192 aa  95.5  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4747  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 192 aa  95.5  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 191 aa  93.6  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 192 aa  70.9  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  26.32 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  25.41 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  23.5 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 248 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2228  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112072 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 195 aa  53.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  28.57 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 202 aa  51.6  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
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NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 248 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  29.67 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_2128  TetR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.544484  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  25.17 
 
 		 191 aa  48.1  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
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NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 199 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
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NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 248 aa  48.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 240 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
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