More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0179 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  401  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 188 aa  140  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 188 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 188 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 197 aa  88.6  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 192 aa  87  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  28.04 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 215 aa  81.3  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  31.58 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 242 aa  67.8  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  26.23 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  23.53 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  26.32 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1479  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  36.47 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 770 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  22.04 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  24.23 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  25.26 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2337  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>