More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2698 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  83.25 
 
 		 191 aa  332  3e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  75.39 
 
 		 191 aa  308  5e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  73.44 
 
 		 192 aa  293  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  59.28 
 
 		 194 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  57.59 
 
 		 190 aa  231  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  57.07 
 
 		 190 aa  225  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  56.32 
 
 		 189 aa  223  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 186 aa  137  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  32.8 
 
 		 193 aa  98.6  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  31.02 
 
 		 191 aa  94.7  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  34.04 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 198 aa  89.4  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 197 aa  85.5  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 196 aa  72  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  35.61 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  30.59 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3254  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  27.01 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  44.58 
 
 		 191 aa  62  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  32.46 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  32.46 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3455  regulatory protein TetR  23.08 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.336833  normal  0.0784455 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2309  transcriptional regulator, TetR family  22.84 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.160392  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 254 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 258 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
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NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
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NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
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NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  40.62 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
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