More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1456 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 215 aa  215  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 197 aa  145  5e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 192 aa  135  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 190 aa  101  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 193 aa  97.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  34.76 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 191 aa  94.7  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 190 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 194 aa  88.6  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 194 aa  88.2  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 191 aa  85.1  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  32.64 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 189 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  27.75 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3254  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  23.63 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
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NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007520  Tcr_1702  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
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NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
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NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  23.87 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  22.51 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
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CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013512  Sdel_0976  regulatory protein TetR  31.52 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00018682  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
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NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
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NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
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NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 288 aa  54.7  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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