More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1256 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  427  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2598  TetR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.256939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  37.86 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1702  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1479  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  34.69 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3254  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2712  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  24.21 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3536  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1439  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.187037  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 254 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 289 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 291 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 183 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 291 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 290 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 290 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 290 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 290 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 290 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 290 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 291 aa  52.4  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3894  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0466911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 241 aa  52  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 188 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 188 aa  52  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 188 aa  52  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 188 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 188 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 174 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0756  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0490671  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 213 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2337  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5365  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5107  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0658  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1176  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1100  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  24.21 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>