More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1848 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 190 aa  387  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
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NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  96.84 
 
 		 190 aa  374  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  62.3 
 
 		 191 aa  247  6e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  60.42 
 
 		 192 aa  246  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  58.64 
 
 		 191 aa  236  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  57.59 
 
 		 203 aa  231  5e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  52.38 
 
 		 189 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  52.06 
 
 		 194 aa  214  8e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 186 aa  135  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  31.91 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  32.98 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 188 aa  101  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 199 aa  95.1  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 188 aa  94.7  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 188 aa  94.7  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 188 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 198 aa  94.4  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 188 aa  94.4  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
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NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 188 aa  89  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 192 aa  87  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 197 aa  86.3  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
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NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 215 aa  85.9  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 213 aa  85.5  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
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NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 202 aa  84.7  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 188 aa  84.3  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  28.8 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
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NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
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NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
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NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
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NC_013061  Phep_3455  regulatory protein TetR  23.75 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.336833  normal  0.0784455 
 
 
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NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
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NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  24.21 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2309  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.160392  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  26.55 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0243  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3254  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  20.4 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
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NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  22.94 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_1334  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180708  normal  1 
 
 
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NC_004116  SAG0258  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.569121  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
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NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  38.36 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
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NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_5456  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
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