More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3717 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  394  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  80.32 
 
 		 193 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  74.47 
 
 		 190 aa  303  8.000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  68.09 
 
 		 194 aa  277  7e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
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NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  69.15 
 
 		 202 aa  272  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  67.72 
 
 		 200 aa  268  5e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  67.2 
 
 		 202 aa  267  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 202 aa  266  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  67.39 
 
 		 190 aa  262  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  66.85 
 
 		 201 aa  258  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  66.85 
 
 		 189 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  66.85 
 
 		 201 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  66.85 
 
 		 201 aa  256  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
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NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  60.54 
 
 		 194 aa  234  4e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  61.41 
 
 		 206 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  57.87 
 
 		 205 aa  229  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 195 aa  166  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 215 aa  110  9e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
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NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
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NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
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NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 197 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
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NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
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NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  36.3 
 
 		 203 aa  94.7  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 187 aa  92  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 190 aa  91.3  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
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NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
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NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
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NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
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NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0243  TetR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 220 aa  71.2  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
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NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4864  TetR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.935636  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_5456  TetR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5406  TetR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313854  normal  0.0102978 
 
 
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NC_008391  Bamb_4747  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.931681 
 
 
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NC_010552  BamMC406_5292  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.505597 
 
 
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NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
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NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
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NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  28.28 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  24.11 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
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NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
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NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
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NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  24.11 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
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NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
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NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
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NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  23.4 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
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NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
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NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  33 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
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NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
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NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
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NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
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NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
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NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 225 aa  57.8  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
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