More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0091 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  414  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  59.9 
 
 		 193 aa  234  6e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  54.55 
 
 		 194 aa  213  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  52.69 
 
 		 198 aa  198  3.9999999999999996e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 203 aa  152  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 188 aa  147  9e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  31.91 
 
 		 191 aa  104  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 190 aa  95.1  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 192 aa  94.7  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 191 aa  86.3  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 194 aa  62  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  30.5 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  25.49 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  46.67 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1188  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  26.14 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3254  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  50 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 324 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  28.66 
 
 		 278 aa  52.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1759  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 289 aa  52  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>