More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0808 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  384  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  83.25 
 
 		 203 aa  332  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  72.77 
 
 		 191 aa  301  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  69.79 
 
 		 192 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  58.64 
 
 		 190 aa  236  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  56.19 
 
 		 194 aa  234  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  58.12 
 
 		 190 aa  230  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  51.58 
 
 		 189 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  99  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 190 aa  89.4  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  32.8 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 215 aa  87  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 199 aa  86.3  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 188 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 188 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 203 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  27.75 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 190 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
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NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 201 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  23.31 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  24.75 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  24.75 
 
 		 193 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 221 aa  62  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  29 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  29 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3254  transcriptional regulator, TetR family  22.56 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 254 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0258  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.569121  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  35.42 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
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NC_013061  Phep_3455  regulatory protein TetR  22.16 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.336833  normal  0.0784455 
 
 
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NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  35.42 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
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NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
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NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
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NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
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