More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0987 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  395  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 201 aa  177  7e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  49.73 
 
 		 189 aa  177  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 201 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 202 aa  175  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  48.63 
 
 		 201 aa  175  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 190 aa  175  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 202 aa  175  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  48.07 
 
 		 190 aa  171  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 202 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  45.9 
 
 		 206 aa  167  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 194 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  45.64 
 
 		 205 aa  164  8e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 194 aa  155  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 192 aa  92  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 197 aa  88.6  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 220 aa  72  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  37.62 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_2228  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112072 
 
 
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NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
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NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  43.3 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  24.83 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  30.89 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
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NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  38.89 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
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NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  30.89 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  34.78 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
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NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0658  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
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NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0807  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2387  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1771  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1600  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  54.9 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2619  HTH-type luminescence regulator LitR  32.1 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2712  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  40 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
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NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_03459  hypothetical protein  36.51 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
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NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
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NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 406 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67022 
 
 
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NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 227 aa  52.4  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_4907  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
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NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
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