More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1027 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  99 
 
 		 201 aa  413  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  98.5 
 
 		 201 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  97.35 
 
 		 189 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  91.01 
 
 		 190 aa  358  3e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  81.15 
 
 		 202 aa  330  7.000000000000001e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  82.2 
 
 		 202 aa  330  8e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  82.2 
 
 		 202 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  81.15 
 
 		 200 aa  324  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  65.95 
 
 		 190 aa  258  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  66.85 
 
 		 191 aa  258  6e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  64.48 
 
 		 194 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  61.42 
 
 		 205 aa  248  4e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  61.5 
 
 		 193 aa  246  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  63.1 
 
 		 206 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  63.78 
 
 		 194 aa  240  9e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 195 aa  175  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 192 aa  125  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  115  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  37.09 
 
 		 203 aa  104  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 189 aa  94.7  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 190 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 186 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 192 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  37.38 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  25.68 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  42.05 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3254  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 497 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 185 aa  62  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  24.82 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0243  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  29.2 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  37.5 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>