More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2735 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  410  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  99.5 
 
 		 215 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 197 aa  232  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0180  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0296493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0183  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0212  transcription regulator TetR/AcrR family protein  33.33 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0194  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 421 aa  65.1  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3071  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0385264  normal  0.592961 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  35.14 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 403 aa  62  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  60.42 
 
 		 194 aa  62  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  56.6 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0500  transcriptional regulator, TetR family  25.63 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  25.4 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2223  TetR family transcriptional regulator  56 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360909  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  27.04 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000716  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 175 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.421465  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 423 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 414 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 324 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0667  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042492  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3612  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000248131  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  30 
 
 		 287 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  36.59 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 332 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 242 aa  52.4  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  56.82 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  30.68 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 285 aa  52  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 236 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3621  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265617  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>