More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0467 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  74.75 
 
 		 213 aa  317  7.999999999999999e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  58.64 
 
 		 203 aa  225  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  51.87 
 
 		 188 aa  219  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  50.8 
 
 		 202 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 188 aa  203  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  41.3 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  38.17 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  38.71 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 198 aa  106  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  32.8 
 
 		 191 aa  92.4  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_3254  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  32.29 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  26.13 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2583  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 226 aa  53.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  39.44 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 438 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 264 aa  52  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  32.05 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 236 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2301  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 290 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 290 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 290 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 290 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 290 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 291 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 289 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4737  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
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NC_013595  Sros_2536  putative transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
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NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 286 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 290 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
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NC_007953  Bxe_C0593  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 268 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65008  normal  0.136354 
 
 
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NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
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NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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