More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4203 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 201 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0593  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65008  normal  0.136354 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4118  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 183 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2010  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2056  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1991  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645683  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2227  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192949  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 275 aa  58.2  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  24.66 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  38.24 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  30.56 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  40.85 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 198 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  47.27 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  37.04 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3493  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4400  regulatory protein TetR  31.31 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 199 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1711  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 177 aa  48.9  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 237 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 233 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2232  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.347192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 218 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 255 aa  48.5  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  35.96 
 
 		 194 aa  48.1  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  32.58 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  40.85 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1714  regulatory protein, TetR  28.91 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.841461  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5327  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  36.92 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  39.29 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  20.95 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5370  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 194 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 237 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 241 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2925  regulatory protein TetR  32.31 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 209 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 187 aa  46.2  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>