More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2536 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2536  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 215 aa  421  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  52.13 
 
 		 203 aa  185  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5337  putative transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4093  transcriptional regulator, TetR family  42.07 
 
 		 200 aa  85.1  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370117  normal  0.493128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1759  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4140  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2870  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0570859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0161  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5342  putative transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.744613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2164  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.652576  normal  0.0672199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2383  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5295  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  28.1 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  42.25 
 
 		 199 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3735  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 185 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  51.06 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  48.94 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  49.23 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 202 aa  48.9  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 223 aa  48.9  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  32.89 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 185 aa  48.5  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  37.97 
 
 		 190 aa  48.5  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 237 aa  48.1  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 203 aa  48.1  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  36.9 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 186 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  28.69 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0810  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 437 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  28.69 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5683  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17527  hitchhiker  0.003772 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  28.69 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1471  hypothetical protein  31.43 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0198707  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2699  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  35 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1334  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 241 aa  46.6  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0578  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 214 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 184 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>