248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0593 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0593  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 268 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65008  normal  0.136354 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  62.84 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 224 aa  105  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2010  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 184 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2056  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 184 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1991  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 184 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645683  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 183 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4118  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2227  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 180 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192949  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 212 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 214 aa  53.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 173 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 173 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 173 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 223 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 225 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 74 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 182 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 198 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 220 aa  50.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 222 aa  50.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 213 aa  50.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 194 aa  49.7  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 222 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  49.3  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 263 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 222 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 186 aa  48.9  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 203 aa  48.9  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 258 aa  48.9  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 183 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 208 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3816  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 192 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 203 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 203 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 229 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1288  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 211 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 198 aa  46.6  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 231 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 225 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 217 aa  46.6  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 242 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 225 aa  46.2  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 217 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 214 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 205 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  40.43 
 
 		 193 aa  46.6  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0339  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 237 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4869  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 224 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 210 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 219 aa  45.8  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 307 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 204 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  33.77 
 
 		 225 aa  45.8  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6395  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 222 aa  46.2  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 203 aa  45.8  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 324 aa  45.8  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 216 aa  45.8  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21540  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 187 aa  45.8  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 194 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 207 aa  45.4  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  29.85 
 
 		 204 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  25.64 
 
 		 230 aa  45.4  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 212 aa  45.4  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 259 aa  45.4  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 205 aa  45.4  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  33.33 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2446  regulator AmrR  31.82 
 
 		 209 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584689  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4962  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 196 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0320648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>