More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3508 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 200 aa  390  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 218 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  35.95 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  38.52 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  40.16 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  47.5 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  37.38 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4374  regulatory protein TetR  33.13 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.985055  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  40.95 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  44.59 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0121  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  44.62 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  37.84 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  33.33 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  37.84 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  34.62 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0566  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  45.12 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3297  TetR family transcriptional regulator  62.79 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
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NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
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NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
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NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  43.1 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
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NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA2969  TetR family transcriptional regulator  60.47 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
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NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A3341  TetR family transcriptional regulator  60.47 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A1572  TetR family transcriptional regulator  60.47 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3954  TetR family transcriptional regulator  60.47 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_4028  TetR family transcriptional regulator  60.47 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_3030  TetR family transcriptional regulator  60.47 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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