More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0464 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  433  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  68.28 
 
 		 185 aa  251  5.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3060  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0482313 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  21.99 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  31.02 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  27.08 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  32.22 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  25.53 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 173 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 173 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  30.63 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  24.5 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  24.69 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10234  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  24.5 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2536  putative transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1248  AcrR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0348  TetR family transcriptional regulator  21.62 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0547  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 198 aa  54.3  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0072  TetR family transcriptional regulator  19.71 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  33.82 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3467  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  25 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1334  TetR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4442  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>