More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4442 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4442  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  453  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4215  TetR family transcriptional regulator  97.82 
 
 		 229 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4281  TetR family transcriptional regulator  97.82 
 
 		 229 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.439471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3060  TetR family transcriptional regulator  78.26 
 
 		 230 aa  340  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0482313 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10234  TetR/AcrR family transcriptional regulator  78.17 
 
 		 229 aa  333  1e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3467  TetR family transcriptional regulator  81.86 
 
 		 228 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3834  transcriptional regulator, TetR family  47.39 
 
 		 218 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  25.45 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 223 aa  62  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0634  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000435144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0639  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  hitchhiker  0.000146714 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4569  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000245113  hitchhiker  0.00602594 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0675  regulatory protein, TetR  29.5 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0771  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.353788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  24.67 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  21.69 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  34.85 
 
 		 230 aa  52  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 216 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1710  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1859  transcriptional regulator  29.85 
 
 		 179 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 189 aa  50.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  27.42 
 
 		 264 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1759  transcriptional regulator  25.77 
 
 		 173 aa  50.1  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0688  transcriptional regulator  34.92 
 
 		 189 aa  49.7  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1633  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124131  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 186 aa  49.3  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  28 
 
 		 251 aa  49.3  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  28.57 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 193 aa  48.9  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  20.99 
 
 		 200 aa  48.9  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 229 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 242 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  43.1 
 
 		 254 aa  48.5  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 216 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 194 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>