295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0072 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0072  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 172 aa  336  9e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0094  TetR family transcriptional regulator  95.93 
 
 		 172 aa  305  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2527  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 176 aa  114  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2301  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  19.71 
 
 		 215 aa  53.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 291 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  22.35 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  21.99 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 211 aa  51.2  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 211 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 211 aa  51.2  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1856  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 185 aa  51.2  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 209 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 211 aa  50.8  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 211 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  22.06 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 212 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  24.66 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 210 aa  49.7  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  24.66 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  21.38 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  22.98 
 
 		 233 aa  49.3  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 201 aa  48.9  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  21.01 
 
 		 196 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  20.42 
 
 		 209 aa  48.9  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 207 aa  48.5  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 192 aa  48.5  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 209 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  20.44 
 
 		 207 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 209 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  24.66 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 208 aa  48.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  20.93 
 
 		 238 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 207 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 212 aa  47.8  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  22.42 
 
 		 198 aa  47.8  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 192 aa  47.8  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  24.66 
 
 		 192 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 188 aa  47.8  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 203 aa  47.4  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 191 aa  47.4  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 211 aa  47.4  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  20.16 
 
 		 178 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  20.16 
 
 		 178 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  20.71 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  21.09 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  30 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 214 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 207 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1365  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25680  transcriptional regulator  28.75 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2869  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  20.43 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  21.38 
 
 		 245 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  14.42 
 
 		 227 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  20.43 
 
 		 199 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 211 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  20.43 
 
 		 199 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  20.43 
 
 		 199 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  20.43 
 
 		 199 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 218 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>