More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_04380 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 72 aa  143  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  40.28 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0767  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 191 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.504408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 188 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 208 aa  57  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4581  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 223 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.19483 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  50 
 
 		 230 aa  57  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 206 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4839  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4927  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0072  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 295 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 212 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 214 aa  53.9  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 206 aa  53.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 207 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 206 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  44.44 
 
 		 219 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 205 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 205 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 202 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3500  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.242129  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 211 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 198 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  37.31 
 
 		 198 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 213 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 209 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 193 aa  52  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 213 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 194 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 196 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 291 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2527  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 212 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 212 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  44.64 
 
 		 194 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4366  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 211 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00655225  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 194 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 212 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  31.58 
 
 		 199 aa  52  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 201 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 218 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 213 aa  51.2  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 204 aa  51.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 201 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 204 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 200 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  58.54 
 
 		 230 aa  51.2  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  38.98 
 
 		 206 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 205 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 287 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 201 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 200 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 209 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 196 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 196 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 196 aa  50.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 196 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 253 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 196 aa  50.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 196 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0094  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 202 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 202 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 215 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 242 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>