More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1468 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 190 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  76.32 
 
 		 190 aa  307  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  64.74 
 
 		 190 aa  256  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  64.74 
 
 		 190 aa  254  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  64.74 
 
 		 190 aa  254  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  64.21 
 
 		 190 aa  254  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  64.21 
 
 		 190 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  64.21 
 
 		 190 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  64.21 
 
 		 190 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  64.21 
 
 		 190 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  63.68 
 
 		 190 aa  251  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  63.68 
 
 		 190 aa  250  7e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  63.68 
 
 		 190 aa  250  7e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  61.75 
 
 		 227 aa  242  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 202 aa  144  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2368  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000142624 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 286 aa  64.7  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 246 aa  64.3  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 188 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 233 aa  62  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  35.56 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  49.09 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5683  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17527  hitchhiker  0.003772 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  26.7 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  32.48 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 398 aa  58.2  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 192 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  25.13 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 291 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
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NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
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NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
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NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
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NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
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NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
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NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
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NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
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NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  27.08 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
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NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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