More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02663 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  422  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  45.27 
 
 		 205 aa  191  9e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  34.18 
 
 		 204 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
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NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 211 aa  134  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  34.69 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 203 aa  132  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
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NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 195 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 204 aa  121  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 217 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 217 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
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NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 201 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  104  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
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NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  30.05 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1346  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010557  BamMC406_5760  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 208 aa  94.7  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327742  normal  0.559912 
 
 
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NC_008392  Bamb_6005  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 208 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  1 
 
 
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NC_011313  VSAL_II0035  putative transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
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NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  36.84 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  33.6 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
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NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  40.17 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
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NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  42.57 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
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NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  23.96 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
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NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
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NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  26.96 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
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NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 251 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
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NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
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NC_013061  Phep_3705  regulatory protein TetR  38.64 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  22.49 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  23.33 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  52.83 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  28.95 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
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NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  38.81 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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