More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1993 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 223 aa  462  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 211 aa  90.1  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6489  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0093  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5533  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 215 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374337  normal  0.0421471 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 540 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  28.17 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  23.96 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  25.13 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5582  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  34.45 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  26.74 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  23.67 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  23.47 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  42.86 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  29.79 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  29.66 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  29.09 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>