More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3202 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  423  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  51.15 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  45.3 
 
 		 212 aa  157  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  49.7 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  46.56 
 
 		 211 aa  148  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  43.24 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 204 aa  142  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0758  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251208 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  41.56 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  35.77 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  27.75 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4128  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4506  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4593  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10871  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4889  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  26.59 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  27.97 
 
 		 262 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  35 
 
 		 265 aa  52.4  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 187 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 186 aa  52  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0243  transcriptional regulator  24.73 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0880  hypothetical protein  34.04 
 
 		 159 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  53.49 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  36 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  34.07 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4475  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 186 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 188 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 540 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  28.42 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4851  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4097  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 188 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 188 aa  48.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>