More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0177 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  392  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2368  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000142624 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 202 aa  85.1  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  28.8 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  23.44 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 243 aa  67.8  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 214 aa  67.8  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  23.24 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  28.71 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  26.58 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 335 aa  65.5  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  29.48 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 297 aa  65.1  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  30.12 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  23.28 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  31.41 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 195 aa  62  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 195 aa  62  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 205 aa  62  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 233 aa  62  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 242 aa  62  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 236 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40380  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  24.14 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>