More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0369 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  410  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  43.5 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  33.5 
 
 		 202 aa  88.2  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  31.71 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  32.95 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  30.62 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 196 aa  62  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1971  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000614274  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0332  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  22.03 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1333  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  28.3 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  31.71 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  35.14 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  30.23 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0674  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 221 aa  52.4  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1567  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.246189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 269 aa  52  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 308 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0976  regulatory protein TetR  27.21 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00018682  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  46 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 242 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 207 aa  51.6  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 209 aa  51.6  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 198 aa  51.6  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>