More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6188 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  98.16 
 
 		 217 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  92.72 
 
 		 217 aa  390  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008392  Bamb_6005  TetR family transcriptional regulator  87.06 
 
 		 208 aa  321  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  1 
 
 
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NC_010557  BamMC406_5760  TetR family transcriptional regulator  87.06 
 
 		 208 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327742  normal  0.559912 
 
 
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NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  76.89 
 
 		 212 aa  317  9e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
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NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  76.96 
 
 		 204 aa  315  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
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NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  74.02 
 
 		 211 aa  310  6.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
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NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  75 
 
 		 204 aa  308  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  76.92 
 
 		 195 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  62.31 
 
 		 202 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  62.63 
 
 		 203 aa  252  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  57.58 
 
 		 200 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  53.2 
 
 		 210 aa  221  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 207 aa  218  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  54.27 
 
 		 204 aa  218  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 203 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 201 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
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NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  35 
 
 		 205 aa  125  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  34.54 
 
 		 204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
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NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  30.77 
 
 		 198 aa  115  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 212 aa  111  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011313  VSAL_II0035  putative transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 202 aa  91.3  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1346  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 219 aa  84.7  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  38.76 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  33.17 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  32 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  34.63 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4809  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  30.85 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  28.77 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
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NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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