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for query gene Psyr_3324 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 204 aa  421  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  90.4 
 
 		 200 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  58.91 
 
 		 202 aa  250  9.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  56.35 
 
 		 211 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  54.77 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  55.28 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  54.27 
 
 		 217 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  54.27 
 
 		 217 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  52.02 
 
 		 210 aa  214  5.9999999999999996e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  54.77 
 
 		 203 aa  214  8e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  55.78 
 
 		 204 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 195 aa  210  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  54.82 
 
 		 204 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 212 aa  197  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5760  TetR family transcriptional regulator  53.09 
 
 		 208 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327742  normal  0.559912 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6005  TetR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 208 aa  178  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 202 aa  144  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 201 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 204 aa  134  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 202 aa  130  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  31.12 
 
 		 198 aa  124  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 203 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  33 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1346  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 209 aa  111  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0035  putative transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 198 aa  95.5  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  29.95 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  31.16 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  28.22 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 210 aa  67.8  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  24.24 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4904  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  30.24 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  29.07 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  27.1 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.07 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  27.03 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
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NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  29.07 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
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NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 289 aa  62  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
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NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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