More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0092 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  415  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 207 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 209 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 209 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 209 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 207 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 203 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  28.08 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
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NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  30.82 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  31.82 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0008  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.643837 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  26.6 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  27.68 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 233 aa  62  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  35.37 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  30.71 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2368  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000142624 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40380  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  21.94 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  36.08 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853887 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  30.46 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
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NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
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NC_014248  Aazo_2823  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335296  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
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NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
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NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
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NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
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NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
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NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
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NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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