More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2799 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  443  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 256 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 246 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 260 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 189 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 194 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 200 aa  105  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 212 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 219 aa  98.2  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 219 aa  98.2  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 219 aa  98.2  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 240 aa  95.5  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 205 aa  95.5  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  28.43 
 
 		 252 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 209 aa  92  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 196 aa  89.4  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 219 aa  88.6  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 219 aa  88.6  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 197 aa  86.3  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 215 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 205 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 205 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 211 aa  85.1  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 189 aa  85.1  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 770 aa  84.7  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  28.88 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  31.92 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  28.71 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  28.18 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  28.11 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
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NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  28.04 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
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NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
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NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
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NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
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