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for query gene Franean1_3594 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  423  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  58.38 
 
 		 208 aa  232  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  29.38 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  23.74 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  28.73 
 
 		 200 aa  72  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 770 aa  68.6  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
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NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  27.84 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  30.68 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
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NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  29.63 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  27.92 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
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NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  28.8 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  27.6 
 
 		 252 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
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NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
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NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
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NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  28.21 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
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NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
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NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  27.03 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 260 aa  58.2  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2454  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  26.49 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
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NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
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NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  24.21 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
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NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 371 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
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NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
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NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
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NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
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