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for query gene Rfer_4061 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



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PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  70.83 
 
 		 256 aa  319  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  59.81 
 
 		 246 aa  270  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  53.69 
 
 		 209 aa  224  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 770 aa  209  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  40.85 
 
 		 252 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  44.28 
 
 		 244 aa  187  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  42.29 
 
 		 260 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 233 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 202 aa  122  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 211 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 238 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 202 aa  105  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 208 aa  98.6  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 212 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 205 aa  95.5  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 201 aa  95.1  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 211 aa  91.7  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 285 aa  90.1  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 231 aa  88.6  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 188 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0810  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 437 aa  78.6  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2454  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  31.25 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2659  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  29.72 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 453 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  24.87 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  27.67 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 215 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 225 aa  72  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 225 aa  72  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  23.96 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3407  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.282297 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 197 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3068  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4414  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.617294  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  22.83 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4844  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  25.56 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
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NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
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NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009511  Swit_1610  TetR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
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NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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