More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3991 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  100 
 
 		 197 aa  391  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  62.03 
 
 		 208 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  63.54 
 
 		 204 aa  241  3.9999999999999997e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  60.43 
 
 		 215 aa  238  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  60.43 
 
 		 205 aa  238  5e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  60.43 
 
 		 205 aa  238  5e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  60.96 
 
 		 200 aa  232  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 197 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  57.95 
 
 		 197 aa  216  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  55.67 
 
 		 210 aa  208  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  48.63 
 
 		 183 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  51.37 
 
 		 222 aa  184  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  46.32 
 
 		 229 aa  175  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  45.13 
 
 		 224 aa  164  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  37.71 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 200 aa  92  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 224 aa  88.6  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 215 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  33.67 
 
 		 198 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 213 aa  88.6  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 204 aa  88.2  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  33.67 
 
 		 207 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 204 aa  85.9  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  24.35 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  31.12 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4158  TetR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 445 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2548  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 482 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2593  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 482 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2587  TetR family transcriptional regulator  56.94 
 
 		 434 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 208 aa  72  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 246 aa  71.2  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  23.62 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  28.73 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4589  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  30.6 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  23.59 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>