More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2587 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2587  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 434 aa  881    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2548  TetR family transcriptional regulator  98.85 
 
 		 482 aa  865    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2593  TetR family transcriptional regulator  98.85 
 
 		 482 aa  865    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4158  TetR family transcriptional regulator  64.39 
 
 		 445 aa  541  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  51.9 
 
 		 204 aa  75.5  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  38.04 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  56.94 
 
 		 197 aa  72.4  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 205 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 205 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  25.62 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 197 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 208 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  35.58 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 224 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 229 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 206 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03122  DNA-binding transcriptional regulator  29.22 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0442  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.671353  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3457  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  29.22 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03073  hypothetical protein  29.22 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.807649  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0442  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  29.22 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  29.22 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00305215  normal  0.159786 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3647  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  29.22 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0126984  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3559  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  29.87 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00735263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3749  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  29.22 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000431628  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  52.94 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 398 aa  57  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 291 aa  57  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 197 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 242 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 211 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  28.57 
 
 		 196 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 192 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  28.57 
 
 		 196 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  28.57 
 
 		 196 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  28.57 
 
 		 196 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 221 aa  55.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  28.57 
 
 		 192 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  28.57 
 
 		 196 aa  54.7  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  28.57 
 
 		 195 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 287 aa  54.3  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 200 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 205 aa  53.9  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 223 aa  53.9  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  29.39 
 
 		 222 aa  53.5  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 210 aa  53.5  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  26.75 
 
 		 198 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 222 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 195 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 235 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 219 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 194 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 196 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 307 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 193 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 194 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  25.2 
 
 		 190 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 207 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 269 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 211 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  21.53 
 
 		 190 aa  51.2  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 211 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 200 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0238  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 191 aa  51.2  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 211 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 211 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 211 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  31.3 
 
 		 220 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 215 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 211 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 210 aa  51.2  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 194 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 259 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  31.75 
 
 		 194 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 201 aa  50.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 209 aa  50.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 		 209 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 212 aa  50.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 209 aa  50.4  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 196 aa  50.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 212 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 200 aa  50.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 193 aa  50.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 183 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 210 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 210 aa  50.4  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 226 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>