More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3312 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  100 
 
 		 198 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  62.5 
 
 		 196 aa  248  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  62.5 
 
 		 196 aa  248  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  62.5 
 
 		 196 aa  248  6e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  62.5 
 
 		 196 aa  248  6e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  62.5 
 
 		 196 aa  248  6e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 196 aa  248  6e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  62.5 
 
 		 195 aa  247  6e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  63.1 
 
 		 192 aa  244  6.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  63.1 
 
 		 192 aa  244  6.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 198 aa  95.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 214 aa  93.2  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 222 aa  88.2  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  38.66 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  33.91 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 199 aa  67.8  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0969  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 204 aa  62  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  26.04 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1088  transcriptional regulator, TetR family protein  28.75 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4056  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  27.72 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1395  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0418723  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3643  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256948 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1229  regulatory protein, TetR  26.25 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  33.33 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  33.33 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1784  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3148  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3108  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1334  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  27.23 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  47.37 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  44.29 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4144  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188303  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>